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如何在2个小时内完整了解一个医学生物研究领域?

Mark Hanson临床科研 2021-01-19
“点击↑↑↑,关注临床科研”

关键词:医学生物;大数据分析;经典文献;实时更新;重症肌无力


好朋友给我发来微信:能否推荐一下重症肌无力领域2分左右的SCI杂志
我沉吟片刻,发回给他一张图:这是重症肌无力最近1万篇论文发表的杂志分布
(领域内最新1万篇论文的发表杂志归属)

在朋友”精准定位“的惊呼中,我不由得动了念头:为何不仔细研究一下这只可爱的”文献鸟“?

好朋友送我一个VIP账号有好久了,尽管我每天通过email收到文献鸟衔来的文献,却除了阅读之外,没有关注其他功能。
(每天收到新发表的论文)

于是,趁着女儿午睡之时,花了2个小时捋清了重症肌无力(myasthenia gravis, MG)这个领域,也大概摸清了文献鸟的强大功能。

原来,我每天收到文献,只是文献鸟的初级功能。
文献鸟还有很多高级功能,不过这些需要付费才行。


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然后我用了高级功能中的Big Analysis,
对Myasthenia gravis进行
大数据分析。

如下是最新发表的一万篇文献的
时间和国家分布图
(论文的时间和国家分布)
时间分布显示,针对myasthenia gravis的研究不温不火,一直相对稳定。最新的10,000篇文献中,最早的是1990年的文章。
这也意味着,下面的数据都是近30年的数据分析结果。

国家分布可以看到,中国已经超过日本,发表的myasthenia gravis研究论文数量仅次于美国。这是中国一代代学者在这个领域长期耕耘和努力的结果。
也看到,目前瑞典只排在第九位,而英国则没有出现在前十名中。这两个国家曾各有一位神级大师,对我的影响非常非常大;惋惜中也有点难过。

另外,需要注意的是,所有数据都可以选择中文显示

接着可以看到
myasthenia gravis研究领域
学术机构排名
(发表论文的机构排名)
自己找亮点哦。我想说的可是我的老东家首都医科大学和乔治华盛顿大学哈,但内心真正佩服的是复旦大学(华山医院)、中南大学(湘雅医院)和中山大学(第一附属医院)。

继续查看研究相关的
热点基因和相关疾病
(研究热点基因和课题)
可以看到,MuSK、CD4、LRP4、AIRE等是myasthenia gravis研究中最受关注的基因;而胸腺瘤、癌症、妊娠、血浆置换、儿童型和狼疮等是与myasthenia gravis最相关的疾病/状态。

继续查发表myasthenia gravis
最多的杂志
(发表论文的杂志分布)
可以看到myasthenia gravis相对集中发表在4本杂志上,其中Muscle & NerveJ Neuroimmunol在2-3分,而Ann N Y Acad SciNeurology则有相对高的影响因子。
参考这个排名,对于投稿有非常强的参考价值。

有人就有江湖,
并形成了圈子;
学术界更是如此。
终于有机会偷窥一下大咖们的关系网了。
下次开会时,
可要提前打印好随身带着。
(学术大咖及其关系网)
在这个网络里,我努力找自己认识的老师和朋友,尤其是找国内的老师,还真是找到了Yang, Huan和Duan, Ruisheng两位老师,不过截图回来再找,竟然找不到了。眼力好的朋友可以帮忙看看哈。
另外,也可以看出,相对于中国发表的论文已经排名第二位,中国的知名学者还不够多。不过,这是之前30年的哈;估计再过30年,这里面就会到处是华人的名字了。

上面关系网中的学者,
是怎么筛出来的呢?
原来是基于学者在该领域的
论文影响因子总分
(学术大咖排名)
上面仅显示影响力(论文总影响因子)最大的几位教授。下面的名单还有很长,因为在这里面没有找到我极为看重的几位国内教授名字,所以我特意问了做管理的朋友,他说是只按照第一和通讯作者的论文影响因子总分做了排名。
另外,如果名字有多种拼法,就会影响结果。比如我自己至少有XIE, Yanchen和XIE, Yan-chen两个拼写方式,那么就肯定会受影响。朋友说:“这可能是你也没有排进来的原因”。(朋友可真会安慰我。我合在一起再翻倍也排不进来啊。)

根据这个大数据分析,我在短时间内对myasthenia gravis的研究热点和领域大牛都有了系统的了解,收获很大。

但是我可不是只会结识人、拉关系的那种人哦。
要想通晓一个领域,经典论文是必读的。

于是我用了“citation network”功能,
一读之下,欣喜若狂;
文献鸟果然不负我。

这是所有10,000篇文献的分布。
每个点都是一篇文献,
左边的是最早发表的;
点的大小代表着这篇论文的影响力,即被引用次数。
(被引用排名)

只打开Top 0.1%的论文,
这肯定是必读论文
顿时觉得,
导师可据此布置读文献的作业了;
学生还会惊叹:
“俺老师老厉害了,
推荐的每一篇论文
都是领域内最重要的论文。”

↓这是Top 0.1%里面最早的一篇;
(被引用次数Top 0.1%的论文)

↓这是Top 0.1%里面最后的一篇;
但总影响力已经排名第五。
可见重症肌无力胸腺切除治疗这项研究
具有多么重要的价值。
而深入了解其背后的故事,
会更感慨万千。
也正是这篇论文,
激发了Hanson临床科研学术交流的启动。
(被引用次数Top 0.1%的论文

↓这是Top 1%的论文分布。
有了这些,
你就知道,
开题报告或基金申请书的立项依据部分,
或论文的前言和讨论部分,
该引哪篇文章了

而顺着论文关系网,
你也更容易捋清这些研究的承接图,
对于自己设计课题非常重要。
(被引用次数Top 1%的论文
特别需要称赞的是,当你点击任何一篇文献,都会出现该文献的信息。

如下,点击代表论文的小点,
可以打开该文献的页面,
查看标题和摘要。
以及Pubmed及其他页面链接。
(文献摘要及链接)

还可以通过列表读到
这些经典论文的具体细节。
同学们,
依次读下去吧,
可不要比你老师厉害太多哦
(被引用最多/最经典的论文排名)

然后,
本文的最大亮点;
不多说。

(mine)

但我其实是
很不满意的,
因为我立马查了Google Scholar,
我这篇论文有26次引用了好不好。
(谷歌学术引用情况)
好吧,我承认,google scholar检索能力太强(太水)了,中文引用都纳入进来了。


了解了领域内的大牛、研究机构,也知晓了领域内的经典论文,顿时感觉“腹有诗书气自华”,腰板挺直了很多。

但是,这些只是存量知识。

未来需要创造!
青年。


文献鸟早已你安排好,
有直达NIH基金资助的检索方式。
(NIH在研课题检索)

也有PubMed检索,
并且以中英文双语的形式展示出来。
太贴心了。
知道我英语不好,
却还想交流时也能冒出一些英语词汇来。
(PubMed检索并显示中英文双语)


简单总结一下文献鸟的五大特长:
  1. 短时间全面了解一个领域的经典论文,容易捋清科研思路;
  2. 更是申请基金、设计课题、撰写论文和投稿选杂志的必要帮手; 
  3. 全面了解该领域内的大咖,还能搞清他们的关系;以及找到进入圈子的敲门砖;
  4. 更重要的,能够实时更新,全面了解美国正在研究的课题随时获知最新发表的论文
  5. 中英文随时切换。


正如向我咨询投稿杂志的朋友,您可能也在问:

怎么用文献鸟

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文献鸟,伴你飞翔。

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